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生物安全柜的工作原理主要是將柜內(nèi)空氣向外抽吸，使柜內(nèi)保持負(fù)壓狀態(tài)，通過垂直氣流來保護(hù)工作人員；外界空氣經(jīng)高效空氣過濾器過濾后進(jìn)入安全柜內(nèi)，以避免處理樣品被污染；柜內(nèi)的空氣也需經(jīng)過HEPA過濾器過濾后再排放到大氣中，以保護(hù)環(huán)境。
生物安全柜有兩個(gè)主要目的：防止污染以保護(hù)樣品，并保護(hù)操作者和實(shí)驗(yàn)環(huán)境免受樣品污染。大多數(shù)生物安全柜采用過濾器和均勻的氣流，在柜體的外部和內(nèi)部之間形成一個(gè)不可見的屏障。如果功能正常，這將保護(hù)樣品不受污染物（如微生物和核酸酶）的影響。
使用生物安全柜時(shí)，確保樣品只能遇到無污染的空氣是至關(guān)重要的。除了使用過濾器外，您還可以通過盡量減少對(duì)生物安全柜的干擾來實(shí)現(xiàn)此目的。在開始之前，確保你需要的所有東西都在生物安全柜內(nèi)部，避免手臂快速移動(dòng)，因?yàn)檫@可能會(huì)引起湍流，從而改變里面的氣流。
生物安全柜使用五大原則：
1、緩慢移動(dòng)原則：為了避免影響正常的風(fēng)路狀態(tài)，柜內(nèi)操作時(shí)手應(yīng)該盡量平緩移動(dòng)。
2、物品平行擺放原則：為了避免物品和物品之間的交叉污染現(xiàn)象產(chǎn)生，在柜內(nèi)擺放的物品應(yīng)該盡量呈橫向一字?jǐn)[開，避免回風(fēng)過程中造成交叉污染。同時(shí)避免堵塞背部回風(fēng)隔柵影響正常風(fēng)路。
3、避免震動(dòng)原則：柜內(nèi)盡量避免震動(dòng)儀器（例如離心機(jī)、旋渦振蕩器等）的使用，因?yàn)檎饎?dòng)會(huì)使得積留在濾膜上的顆粒物質(zhì)抖落，導(dǎo)致操作室內(nèi)部潔凈度降低，同時(shí)如果在前操作面平衡失敗還會(huì)引起安全柜對(duì)操作者的污染。
4、不同樣品柜內(nèi)移動(dòng)原則：柜內(nèi)兩種及以上物品需要移動(dòng)時(shí)，一定遵循低污染性物品向高污染性物品移動(dòng)原則。
5、明火使用原則：柜內(nèi)盡量不要使用明火。因?yàn)樵诿骰鹗褂眠^程中產(chǎn)生的細(xì)小顆粒雜質(zhì)將被帶入濾膜區(qū)域，這些高溫雜質(zhì)會(huì)損傷濾膜。
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